Weekly Report of Seasonal or Epidemic Viruses Detected
| a : Samples tested may be obtained from patients at Yale New Haven Hospital, from other hospitals in the region, from community doctors’ offices or clinics | |||||||||||||||||||||||||||||
| b : PCR is predominant test used, unless otherwise stated | |||||||||||||||||||||||||||||
| c : ELISA not PCR | |||||||||||||||||||||||||||||
| d : West Nile based on IgM in CSF or serum; rarely PCR. No. positive patients, not samples. Week reflects when result reported. | |||||||||||||||||||||||||||||
| e : Powassan based on IgM in CSF or serum. No. positive patients, not samples. Week reflects when result reported. | |||||||||||||||||||||||||||||
| RSV, respiratory syncytial virus; HMPV, human metapneumovirus; CoV, coronaviruses 229E, OC43, NLS63 and HKU1 | |||||||||||||||||||||||||||||
| 2019 | RSV | Flu A | Flu B | Paraflu1,2,3,4 | Adeno | HMPV | Rhino | CoV | Entero | Parecho | Rotac | Noro | WNVd | Powassane |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8/24-8/30 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | |||||||||||||||
| 8/17-8/23 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | |||||||||||||||
| 8/10-8/16 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | |||||||||||||||
| 8/3-8/9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | |||||||||||||||
| August | |||||||||||||||||||||||||||||
| 7/28-8/3 | 0 | 3 | 0 | 4 | 0 | 1 | 9 | 1 | 2 | -- | 0 | 0 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 7/21-7/27 | 0 | 2 | 0 | 2 | 4 | 0 | 11 | 2 | 0 | -- | 0 | 0 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 7/14-7/20 | 0 | 0 | 0 | 8 | 2 | 4 | 21 | 6 | 0 | -- | 0 | 0 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 7/7-7/13 | 0 | 1 | 0 | 6 | 3 | 0 | 20 | 9 | 0 | -- | 0 | 2 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 6/30-7/6 | 0 | 2 | 0 | 8 | 3 | 2 | 21 | 5 | 0 | -- | 1 | 0 | 0 | -- | |||||||||||||||
| July | |||||||||||||||||||||||||||||
| 6/23-6/29 | 0 | 5 | 0 | 4 | 6 | 0 | 44 | 3 | 0 | -- | 0 | 0 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 6/16-6/22 | 0 | 0 | 0 | 6 | 6 | 2 | 36 | 4 | 0 | -- | 0 | 5 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 6/9-6/15 | 1 | 2 | 0 | 15 | 2 | 1 | 39 | 3 | 0 | -- | 0 | 4 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 6/2-6/8 | 0 | 2 | 0 | 22 | 2 | 5 | 39 | 5 | 0 | -- | 0 | 3 | 0 | -- | |||||||||||||||
| June | |||||||||||||||||||||||||||||
| 5/26-6/1 | 0 | 3 | 1 | 11 | 4 | 7 | 33 | 5 | 0 | -- | 0 | 0 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 5/19-5/25 | 0 | 2 | 2 | 20 | 4 | 7 | 44 | 5 | 0 | -- | 1 | 0 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 5/12-5/18 | 2 | 0 | 1 | 21 | 4 | 8 | 40 | 9 | 0 | -- | 0 | 1 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 5/5-511 | 2 | 2 | 1 | 21 | 5 | 9 | 35 | 7 | 1 | -- | 0 | 5 | 0 | -- | |||||||||||||||
| May | |||||||||||||||||||||||||||||
| 4/28-5/4 | 2 | 3 | 1 | 30 | 4 | 8 | 42 | 8 | 0 | -- | 0 | 2 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 4/21-27 | 1 | 12 | 5 | 27 | 6 | 4 | 25 | 14 | 0 | -- | 0 | 5 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 4/14-4/20 | 1 | 19 | 8 | 25 | 5 | 21 | 26 | 14 | 0 | -- | 1 | 3 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 4/7-4/13 | 5 | 40 | 8 | 17 | 7 | 18 | 19 | 16 | 0 | -- | 0 | 9 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 3/31-4/6 | 3 | 44 | 5 | 6 | 4 | 15 | 30 | 10 | 0 | -- | 0 | 10 | 0 | -- | |||||||||||||||
| April | |||||||||||||||||||||||||||||
| 3/24-3/30 | 5 | 59 | 6 | 5 | 5 | 16 | 22 | 18 | 0 | -- | 0 | 20 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 3/17-3/23 | 5 | 70 | 2 | 6 | 6 | 21 | 28 | 24 | 0 | -- | 1 | 6 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 3/10-3/16 | 13 | 89 | 6 | 8 | 3 | 25 | 27 | 23 | 0 | -- | 1 | 5 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 3/3-3/9 | 15 | 82 | 1 | 8 | 5 | 17 | 9 | 28 | 0 | -- | 0 | 10 | 0 | -- | |||||||||||||||
| March | |||||||||||||||||||||||||||||
| 2/24-3/2 | 13 | 91 | 2 | 5 | 7 | 15 | 20 | 35 | 0 | -- | 0 | 6 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 2/17-2/23 | 21 | 121 | 1 | 7 | 7 | 15 | 21 | 24 | 0 | -- | 0 | 12 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 2/10-2/16 | 20 | 126 | 1 | 2 | 10 | 13 | 16 | 32 | 0 | -- | 0 | 11 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 2/3-2/09
February |
28 | 201 | 0 | 1 | 9 | 16 | 20 | 51 | 0 | -- | 0 | 13 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 1/27-2/2 | 44 | 163 | 0 | 1 | 9 | 10 | 27 | 48 | 0 | -- | 0 | 8 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 1/20-1/26 | 32 | 130 | 1 | 8 | 7 | 10 | 21 | 43 | 0 | -- | 0 | 8 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 1/13-1/19 | 32 | 100 | 1 | 6 | 6 | 5 | 21 | 41 | 0 | -- | 0 | 7 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 1/6-1/12 | 48 | 82 | 1 | 8 | 4 | 13 | 31 | 38 | 0 | -- | 0 | 6 | 0 | -- | |||||||||||||||
| 12/31-1/5
January |
58 | 79 | 0 | 6 | 7 | 14 | 52 | 35 | 0 | -- | 0 | 11 | 0 | -- | |||||||||||||||
Virology Table
| f : influenza subtyping performed only on hospitalized patient samples during flue season. Testing is batched, and counts updated as testing is completed. | ||||||||||||
| 2019 | Total Subtyped | pdmH1 | H3> | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8/24-8/30 | - | - | - | |||||||||
| 8/17-8/23 | - | - | - | |||||||||
| 8/10-8/16 | - | - | - | |||||||||
| 8/3-8/9 | - | - | - | |||||||||
| August
|
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| 7/28-8/20 | 0 | 0 | ||||||||||
| 7/21-7/27 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 7/14-7/20 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 7/7-7/13 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 6/30-7/6 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| July
|
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| 6/23-6/29 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 6/16-6/22 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 6/9-6/15 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 6/2-6/8 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| June
|
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| 5/27-6/1 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 5/19-5/25 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 5/12-5/18 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 5/5-5/11 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 4/28-5/4 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| May
|
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| 4/21-4/27 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 4/14-4/20 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 4/7-4/13 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 3/31-4/6 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| April
|
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| 3/24-3/30 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 3/17-3/23 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 3/10-3/16 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 3/3-3/9 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| March
|
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| 2/24-3/2 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 2/17-2/23 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 2/10-2/16 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 2/3-2/9 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| February
|
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| 1/27-2/2 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 1/20-1/260 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 1/13-1/19 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| 1/6-1/12 | 0 | 0 | 0 | |||||||||
| January
12/30/18-1/5 |
0 | 0 | 0 | |||||||||